截止今年9月底，湖州航区特种船舶拥有量为291艘、10.84万载重吨，分别占全省内河特种船舶总量的48.3和47。其中集装箱船24艘、1.9万载重吨，多用途船（集散两用）17艘、2万载重吨，散装水泥船239艘、6.47万载重吨，油货船11艘。前三季度，全市淘汰油货船、危险化学品船7艘、2086载重吨，新增特种船舶12艘、15509载重吨，较去年底分别增长4.5、17.5。
今年以来，湖州港航部门积极推进航运业结构调整，推动产业发展新模式，鼓励经营户发展内河集装箱船、多用途船等特种船舶运输。一是内河集装箱运输快速增长。安吉川达从2010年12月份营运以来，集装箱运输发展迅猛，运力逐年快速递增，目前集装箱船舶运力为24艘、1068标箱，10月即将开建2艘48标箱集装箱船舶；长兴兴能航运公司新建14艘、15652载重吨多用途船，浙江兴一航运公司新建3艘48标箱集散两用船，还有13艘48标箱集散两用船在建或待建，将与德清多功能港区合作，经营集装箱内外贸运输；湖州鑫达国际物流公司与上海汉升航运公司合作成立了湖州鑫汉国际物流有限公司，改建完成一艘30标箱集装箱船舶。二是水路散装水泥运输前景看好。随着周边城市建筑市场对湖州水泥需求的日益扩张，2014年湖州市水泥散装量完成1210万吨，其中70是通过水路散装运往周边城市建筑工地，根据市散装水泥办的预测，今年全市水泥散装量保持在1150万吨左右，将有效推动湖州市散装水泥船运力的较快发展。
